fa شناسایی ژن‌های موثر جدید در پیشبرد مقاومت به اریترومایسین در کمپیلوباکتر ژژونی با بهره‌گیری از ابزار بیوانفورماتیکی میکروبیولوژی پزشکی پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar="">آنتی‌بیوتیک‌های ماکرولید برای درمان عفونت‌های ناشی از <a name="_Hlk136183188"><i>کمپیلوباکترژژونی</i> </a>مهم هستند. ایجاد مقاومت در برابر این دسته از آنتی‌بیوتیک‌ها در <i>کمپیلوباکتر</i> فرایندی پیچیده توام با تغییرات مولکولی پویا است که به خوبی تعریف نشده‌اند. در پژوهش حاضر برای پرکردن جای خالی موجود در ارتباط با ایجاد مقاومت آنتی‌بیوتیکی به درمان با اریترومایسین، پاسخ ترنسکریپتومیک <i>کمپیلوباکترژژونی </i>سویه‌ی<i> </i>11168</span></span> NCTC&nbsp;<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar="">به درمان با اریترومایسین (</span></span>ERY<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar="">) با روش میکرواری تعیین شد. داده‌های به‌دست‌آمده شناسایی، استخراج و با ابزارهای آنلاین </span></span>GEO2R<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar=""> و نرم‌افزار</span></span>R<span style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar=""> آنالیز شدند. ژن‌های با بیشترین بیان افتراقی با استفاده پارامترهای </span></span><i>p</i><0.05<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar=""> و </span></span>|<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar="">1<</span></span>LogFC |<span style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar=""> شناسایی شدند.</span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar="">سپس، بیان ژن‌های مرتبط جدا و برای ژن‌های با افزایش بیانی، توسط پایگاه‌ داده </span></span>STRING<span style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar=""> شبکه پروتئینی در نظر گرفته ‌شد و با نرم‌افزار </span></span>&nbsp;Cytoscape<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar="">رسم شد. با شناسایی ژن‌های مختلف با کاهش و یا افزایش بیان معنادار، مشخص شد مجموعه‌ای از ژن‌های </span></span><i>flaA, flaB, flgB, CmeC, sdhA, sdhB</i><i> </i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" style="font-family:" zar="">می‌توانند در مقاومت آنتی‌بیوتیکی <i>کمپیلوباکتر ژژونی </i>نسبت به درمان با آنتی‌بیوتیک اریترومایسین نقش داشته ‌باشند. در این مطالعه با بررسی اهداف، اثرگذاری و آنالیز عملکردی این ژن‌ها، راهکارهای مناسبی برای مهار مقاومت ارائه‌ گردید.</span></span></span></span></span></span></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="line-height:normal"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Macrolide antibiotics are important for the treatment of <i>Campylobacter jejuni</i> infections. Resistance to this class of antibiotics in <i>Campylobacter</i> is a complex process with dynamic molecular changes that are not well defined. In the present study, to fill the gap related to antibiotic resistance to Erythromycin treatment, the transcriptomic response of <i>Campylobacter jejuni</i> strain NCTC11168 to Erythromycin (ERY) treatment was determined by microarray method. The obtained data were identified, extracted and analyzed with GEO2R online tools and R software. Genes with the highest differential expression were identified by using parameters P<0.05 and LogFC |>1|. Then, the expression of the related genes was separated and for the genes that had an increase in expression, the protein network was predicted through the STRING database and visualized with the Cytoscape software. By identifying different genes that had a significant decrease or increase in expression, it was found that a set of <i>flaA, flaB, flgB, CmeC, sdhA, sdhB</i> genes can play a role in the antibiotic resistance of <i>Campylobacter jejuni</i> to the treatment with Erythromycin antibiotic. In this study by examining the goals, effectiveness and functional analysis of these genes, suitable solutions to curb the resistance were presented.</span></span></span></span></div> مقاومت آنتی‌بیوتیکی, کمپیلوباکترژژونی, اریترومایسین, میکرواری Antibiotic resistance, Campylobacter jejuni, Erythromycin, Microarray 38 48 http://amfi.ir/browse.php?a_code=A-10-91-1&slc_lang=fa&sid=1 Mahlagha Cheraghi مه لقا چراغی mahlagha.cheraghi@gmail.com 2640198408 0009-0008-2470-0518 No Master student, Department of Biology Faculty of convergent sciences & technoligies, Central Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه زیست شناسی، دانشکده علوم و فناوری های همگرا، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکز، تهران، ایران Nastaran Asghari Moghaddam نسترن اصغری مقدم nas.asgharimoghaddam@iauctb.ac.ir 0067460429 1003194753284600450 Yes Assistant professor, Department of Biology, Faculty of convergent sciences & technoligies, Central Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه زیست شناسی، دانشکده علوم و فناوری های همگرا، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکز، تهران، ایران Bita Bakhshi بی تا بخشی b.bakhshi@modares.ac.ir 1755750986 1003194753284600451 No Professor, Department of Bacteriology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran گروه باکتری شناسی پزشکی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران